| 序号 | 遗产名称 | 遗产性质 | 所在洲 | 所在国家 | 入列时间 | 特点 | 征稿情况 | 查看详情 |
| 第498号 | 贝加尔湖 | 自然遗产 | 欧洲 | 俄罗斯 | 1996 | 充满神秘的水域 | 2幅 | 点击查看 |
| 第499号 | 堪察加火山 | 自然遗产 | 欧洲 | 俄罗斯 | 1996 | 诸神烧烤鲸鱼的地方 | 无 | 点击查看 |
| 第506号 | 赫德岛和麦当劳岛（澳大利亚） | 自然遗产 | 大洋洲 | 澳大利亚 | 1997 | 亚极地天幕下的火山肩膀 | 无 | 点击查看 |
| 第507号 | 麦卡里岛 | 自然遗产 | 大洋洲 | 澳大利亚 | 1997 | 企鹅岛 | 无 | 点击查看 |
| 第508号 | 桑达班斯的红树林 | 自然遗产 | 亚洲 | 孟加拉国 | 1997 | 孟加拉虎在海陆间的·逡巡之所 | 无 | 点击查看 |
| 第513号 | 科科斯岛国家公园 | 自然遗产 | 美洲 | 哥斯达黎加 | 1997 | 赌徒与金币 | 无 | 点击查看 |
| 第514号 | 三峰山的国家公园 | 自然遗产 | 美洲 | 多米尼克 | 1997 | 星期日的岛上万物的竞赛 | 无 | 点击查看 |
| 第529号 | 肯尼亚国家公园 | 自然遗产 | 非洲 | 肯尼亚 | 1997 | 给了一个国家名字的山 | 无 | 点击查看 |
| 第530号 | 锡比罗依和中心岛国家公园（哺乳动物和类人猿化石发掘地） | 自然遗产 | 非洲 | 肯尼亚 | 1997 | “玉海”边先民们的印迹 | 无 | 点击查看 |
| 第569号 | 新西兰次南极区群岛—奥克兰群岛 | 自然遗产 | 大洋洲 | 新西兰 | 1998 | 生物多样性的空间站 | 无 | 点击查看 |
| 第572号 | 阿尔泰的金山 | 自然遗产 | 亚洲 | 俄罗斯 | 1998 | 波涛汹涌的河流、融化冰川和高原木乃伊 | 无 | 点击查看 |
| 第573号 | 东伦内尔环形珊瑚岛 | 自然遗产 | 大洋洲 | 所罗门群岛 | 1998 | 从大洋底部崛起 | 无 | 点击查看 |
| 第583号 | 瓦尔德斯半岛 | 自然遗产 | 美洲 | 阿根廷 | 1999 | 没有饲养员和栅栏的动物园 | 无 | 点击查看 |
| 第586号 | 科斯塔多德斯科布里门托（“发现的海岸”） | 自然遗产 | 美洲 | 巴西 | 1999 | 征服者卡布拉尔首次踏上新世界的地方 | 无 | 点击查看 |
| 第587号 | 玛塔大西洋地区（巴西东南部的大西洋热带雨林） | 自然遗产 | 美洲 | 巴西 | 1999 | 经济的发展果真要摧毁这个人间天堂吗 | 无 | 点击查看 |
| 第590号 | 关纳卡斯特保护区 | 自然遗产 | 美洲 | 哥斯达黎加 | 1999 | 毒蛇会咬第三个人 | 无 | 点击查看 |
| 第599号 | 洛伦茨国家公园 | 自然遗产 | 亚洲 | 印度尼西亚 | 1999 | 热带上空的冰川覆盖 | 无 | 点击查看 |
| 第609号 | 穆鲁山国家公园 | 自然遗产 | 亚洲 | 马来西亚 | 2000 | 被称作皇冠上的明珠，有全世界最大的天然石洞及全球罕见的石林 | 无 | 点击查看 |
| 第610号 | 基纳巴卢山公园 | 自然遗产 | 亚洲 | 马来西亚 | 2000 | 世界上再也找不到这样一个植物生态的会合地 | 无 | 点击查看 |
| 第617号 | 高海岸/克瓦尔肯群岛 | 自然遗产 | 欧洲 | 瑞典和芬兰 | 2000 | 被冰川重力压迫的陆地,在冰川融化退却后再度回升抬高陆地回弹抬升的结果，便出现大量岛屿 | 无 | 点击查看 |
| 第642号 | 伊奥利亚群岛 | 自然遗产 | 欧洲 | 意大利 | 2000 | Alicudi、Filicudi、 Lipari、Panarea、Salina、Stromboli 和 Vulcano是组成伊奥利亚群岛的7大岛。 | 无 | 点击查看 |
| 第651号 | 伊沙瓜拉斯托－塔拉姆佩雅自然公园 | 自然遗产 | 美洲 | 阿根廷 | 2000 | 人们称之为“月亮谷” | 无 | 点击查看 |
| 第653号 | 挪尔·肯普夫墨卡多国家公园 | 自然遗产 | 美洲 | 玻利维亚 | 2000 | 亚马逊盆地最大和保护最为完好的公园之一 | 无 | 点击查看 |
| 第656号 | 亚马逊河中心保护区 | 自然遗产 | 美洲 | 巴西 | 2000 | 世界上生物最多样化的区域之一 | 无 | 点击查看 |
| 第657号 | 潘塔纳尔保护区 | 自然遗产 | 美洲 | 巴西 | 2000 | 潘塔纳尔保护区的潘塔纳尔湿地是世上最大的淡水湿地生态保护系统之 | 无 | 点击查看 |
| 第658号 | 苏里南中心自然保护区 | 自然遗产 | 美洲 | 苏里南 | 2000 | 形态丰富多样的山峦、地形、土壤形成了这里多样化的生态系统 | 无 | 点击查看 |
| 第663号 | 大蓝山山脉 | 自然遗产 | 大洋洲 | 澳大利亚 | 2000 | 澳大利亚最大和最完整的受保护的丛林地带之一 | 无 | 点击查看 |
| 第670号 | 中锡霍特山脉 | 自然遗产 | 欧洲 | 俄罗斯 | 2001 | 对于东北虎等濒危生物的存活至关重要。 | 无 | 点击查看 |
| 第676号 | 瑞士阿尔卑斯山少女峰·阿莱奇冰川 | 自然遗产 | 欧洲 | 瑞士 | 2001,2007扩大 | 遗产地为阿尔卑斯高山地貌的典范例证 | 6幅（组） | 点击查看 |
| 第678号 | 东德文的侏罗纪海岸 | 自然遗产 | 欧洲 | 英国 | 2001 | 300多年来对地球科学研究作出了贡献 | 无 | 点击查看 |
| 第691号 | 费尔南多－迪诺罗尼亚岛和罗卡斯岛 | 自然遗产 | 美洲 | 巴西 | 2001 | 一幅美丽的海景画 | 无 | 点击查看 |
| 第692号 | 塞拉多保护区一沙帕达·杜韦阿代鲁斯和埃马 | 自然遗产 | 美洲 | 巴西 | 2001 | 颇具特色的动植物柄息地 | 无 | 点击查看 |
| 第694号 | 亚历山大·洪堡国家公园 | 自然遗产 | 美洲 | 古巴 | 2001 | 复杂多样的地质地貌特征 | 无 | 点击查看 |
| 第705号 | 乌布苏盆地 | 自然遗产 | 亚洲 | 蒙古和俄罗斯 | 2003 | 东欧亚大陆最重要的生物群落区 | 无 | 点击查看 |
| 第706号 | 方芽－科邦国家公园 | 自然遗产 | 亚洲 | 越南 | 2003 | 生态多样性 | 无 | 点击查看 |
| 第716号 | 圣乔治山 | 自然遗产 | 欧洲 | 瑞士和意大利 | 2003 | 圣乔治山出土的三叠纪海洋生物化石，迄今为止是最好的 | 无 | 点击查看 |
| 第728号 | 波奴鲁鲁国家公 | 自然遗产 | 大洋洲 | 澳大利亚 | 2003 | 澳大利亚内陆的瑰宝 | 无 | 点击查看 |
| 第733号 | 苏门答腊热带雨林 | 自然遗产 | 亚洲 | 印度尼西亚 | 2004 | 濒临灭绝 | 无 | 点击查看 |
| 第743号 | 伊路利萨特冰湾 | 自然遗产 | 欧洲 | 丹麦 | 2004 | 世上最活跃的冰川之一 | 无 | 点击查看 |
| 第746号 | 弗兰格尔岛自然保护区 | 自然遗产 | 欧洲 | 俄罗斯 | 2004 | 野生动植物的避难所 | 无 | 点击查看 |
| 第759号 | 开普植物保护区 | 自然遗产 | 非洲 | 南非 | 2004，2015年扩大 | （开普植物王国） | 无 | 点击查看 |
| 第760号 | 皮通山保护区 | 自然遗产 | 美洲 | 圣卢西亚 | 2004 | 皮通·密坦岭将两座火山锥—大皮通山和小皮通山连在一起 | 无 | 点击查看 |
| 第764号 | 知床半岛 | 自然遗产 | 亚洲 | 日本 | 2005 | “日本最后的秘境” | 无 | 点击查看 |
| 第765号 | 东巴耶延山一考爱山森林保护区 | 自然遗产 | 亚洲 | 泰国 | 2005 | 濒临灭绝物种的栖息之地 | 无 | 点击查看 |
| 第772号 | 挪威西峡湾-盖朗厄尔峡湾和纳柔依峡湾 | 自然遗产 | 欧洲 | 挪威 | 2005 | 盖朗厄尔峡湾以瀑布众多而著称。纳柔依峡湾是世界最窄的峡湾 | 无 | 点击查看 |
| 第780号 | 埃及鲸鱼峡谷 | 自然遗产 | 非洲 | 埃及 | 2005 | 世界上最重要的进化阶段的实证 | 无 | 点击查看 |
| 第782号 | 弗里德堡陨石坑 | 自然遗产 | 非洲 | 南非 | 2005 | 研究陨石撞击后星体的起源和发展成为可能 | 无 | 点击查看 |
| 第785号 | 加利福尼亚湾群岛及保护区 | 自然遗产 | 美洲 | 墨西哥 | 2005 | 为几乎全部的海洋领域的海洋科学家提供了极其重要的研究 | 无 | 点击查看 |
| 第786号 | 柯义巴岛国家公园 | 自然遗产 | 美洲 | 巴拿马 | 2005 | 自然实验室 | 无 | 点击查看 |
| 第787号 | 四川大熊猫栖息地 | 自然遗产 | 亚洲 | 中国 | 2006 | 从某种意义上来讲，它可以说是一个“活的博物馆” | 无 | 点击查看 |